光合作用计算超级计算机的最初时刻




复杂LHC-II的方案来收集光能:叶绿素a表示绿松石色,叶绿素b - 绿色 I>

光合作用在植物和动物 - 光以其转化率和化学形式积累的能量子的本体的反应中心的吸收。合成的有机物质,然后燃料进入细胞内的反应。

<一href="https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A0%D0%B5%D0%B0%D0%BA%D1%86%D0%B8%D0%BE%D0%BD%D0%BD%D1%8B%D0%B9_%D1%86%D0%B5%D0%BD%D1%82%D1%80">Реакционный中心 - 高蛋白superkompleks fotosobirayuschih有多个天线。科学家们还在继续研究它的结构和功能。也许,有一天将使合成类似物具有相同的高效率。从巴斯克地区大学(西班牙)科学家组成的联合小组,巴塞罗那(西班牙)大学,劳伦斯·利弗莫尔国家实验室(美国,哈雷 - 维滕贝格大学(德国),列日(比利时)和科英布拉大学(葡萄牙)的大学促成了这一研究通过检查fotosobirayuschih构建复杂LHC-II(轻收获复合物II)与叶绿素,仿真LHC-II的推出在欧洲几个强大的超级计算机在同一时间。

有关在其他科学文章。开发成功地创造出量子力学的处理的一个可靠的计算机模型,在光合作用过程中发生在复杂的反应。

下图显示了一个简化的仿真的例子,自适应网格叶绿素分子 A I>的节点0,5和2,5半径之间的距离。每种颜色对应于可以被转移为对计算的大规模并行一个单独的处理器的计算上的一个或几个超级计算机在同一时间的区域。



复杂的LHC-Ⅱ工作在光合作用的植物的第一步,由000 17原子。不能肯定究竟进入光子理论时虽然有可靠在这方面是在这个复杂的量子过程。

通过并行化过程中,科学家们能够在几个超级计算机,它工作在并行运行的仿真。该实验是一个德国的超级计算机Juqueen(458752内核),意大利的费米(163,840核心),德国九头蛇(65320芯),加泰罗尼亚计算机MareNostrum III(48896芯)等超级计算机,建立了欧洲的大学。

其主要目的是为了优化八达通代码,研究它在一个真正的分布式系统,并选择该程序的正确参数。模拟整个分子LHC-II的 - 不可能完成的任务,所以科学家们使用一个模型5759,4050和6075的原子。今天它是最大型模拟光合作用的在一个复杂的LHC-Ⅱ的过程。

通过实验未能证实描述光合作用的LHC-Ⅱ内的在第15飞秒接收的光子的反应后的理论。

由于摩尔定律和代码优化八达通希望不久将有可能效仿光合作用的过程中完成的分子与17 000的所有原子。此外,免费的软件可以使用来自其他国家的分布式计算和除了LHC-II其他分子的模拟八达通的科学家。

科学的研究结果发表在一篇文章&QUOT; 洞察色彩调整的绿色植物叶绿素光学响应>&QUOT; I>在杂志物理化学物理化学 I> 2015年7月17日,文章在开放获取(的)。

资料来源: