OpenWorm: цифрова модель нематодного черв'яка в браузері

крихітні нематодні, або круглі черв'яки Caenorhabditis elegans, це приблизно міліметр довго, один з найбільш вивчених організмів на Землі. Це перший багатоклітинний організм, геном якого був повністю послідовний. С. elegans мають два секси – чоловічки і гермафордити. Дорослий гермофорит складається з всього 959 клітин і його нервової системи складається з 302 нейронів. Всі зв’язки між нейронами С. elegans (з'єднаннями) повністю описані. Достаток комплексної наукової інформації про цей черв’як і відносна простота його пристрою кілька років тому надихнула колектив лабораторії для моделювання комплексних систем Інституту інформатики ім. А. П. Ершова СБ RAS для створення вичерпної комп’ютерної моделі С. селеганів.

Згодом проект приваблював кілька десятків учасників по всьому світу, але продовжував залишатися маловідомими і недоступними для загального публіки: це не так легко зрозуміти кількість сирих даних, пов'язаних з пристроєм черв'яка, і багато підсистем моделі, написаних різними мовами програмування, не кажучи вже про встановлення і запустити все це на вашому комп'ютері. При цьому с. селегани широко використовуються при дослідженні біології, а також здатності «побрати» модель глибина, з деталями і динамією розглянути, як це працює, важко переоцінити. Таким чином, команда проекту вирішила зробити модель, доступна онлайн – так що хтось може просто перейти на сайт проекту і подивитися на «матрикс», в якому живе віртуальний організм. Це суть проекту OpenWorm на Kickstarter.



творці моделі очікують на збір 120 тис. дол. За перший день, зібраний близько 10% цієї суми, тому шанси успіху досить хороші. Запобіжники, які бажають пожертвувати 49 доларів, отримають можливість розпочати персональну модель С. селеганів на веб-сайті проекту та дотримувати його «живо» – вивчити тіло зсередини та зовні за допомогою тривимірної візуалізації та спостерігати найменші, вниз до окремих клітин, деталі його життєдіяльності.

Крім того, буде створено онлайн-курс, який роз’ясує як пристрій самого черв’яка, так і алгоритми, які використовуються для створення його моделі. Введіть номер мобільного, який Ви вказали при укладаннi договору з банком - для ідентифікації. Команда OpenWorm Academy обіцяє розпочати це літо, а також працювати на сайті з імітацією глибин очікується закінчити наступну пружину.



Джерело: habrahabr.ru/post/220095/