Cacao genoma ayudará a desarrollar la industria del chocolate

En 2008, IBM y Marte forman un equipo conjunto para trabajar en descifrar el genotipo de cacao. Vale la pena señalar que la transcripción del genotipo de las plantas no es algo nuevo. Los científicos ya han conseguido un mapa del genoma del arroz, mostaza y algunas otras plantas, incluyendo el cacao (2010).

Descifrando el mismo genoma del cacao fue llevado a cabo para ayudar a la industria obtener más cacao que crece sano, resistente a los factores externos adversos, planta. La fase inicial de este trabajo terminó con un resultado interesante: resulta que, una porción del genoma que es responsable del color de las plantas puede ser un indicador de la salud de las plantas, así como el sabor de los granos de cacao
.
¿Por qué la industria cacao / chocolate de las necesidades de apoyo?

• Alrededor del 70% de la actual cosecha de cacao producido en el África ecuatorial;
• 2 millones de pequeñas granjas de cacao en África Occidental dependen de esta planta;
• 1/3 de las plantaciones de cacao en África se pierden debido a la sequía, las plagas y las enfermedades fúngicas;
• Sólo en la industria del "chocolate" pierde US $ 800 000 000, como resultado de los problemas mencionados anteriormente mencionadas.

Como se analiza
genoma
Con el fin de secuenciar el material genético del cacao, los investigadores tomaron muestras de hojas, vainas y algunas otras partes de la planta, de enviarlo todo al laboratorio del Servicio de Investigación Agrícola (ARS). Secuenciador de ADN nucleótidos identificados necesarios para el análisis. Bueno, el trabajo de IBM, Marte, y el Ministerio de Agricultura ya estaba recibiendo tarjetas genoma. El trabajo en descifrar cacao genotipo tomó tres años, la obra ha sido decodificado por más de 30 mil genes.

A partir de entonces, los sistemas informáticos han comenzado a analizar estos genes utilizando algoritmos específicos para identificar los patrones de genes. El equipo trabajó en la investigación con muestras de tejidos de cacao desde diferentes puntos del mundo, se trata de comparar los genomas de diferentes especies kakako para identificar las partes críticas del genoma responsables de importantes propiedades humanos de esta planta, incluyendo el sabor, resistencia a las enfermedades, la falta de humedad y otros factores. < br />


Según el Dr. Laxmi Parida, director del departamento de informática геномики IBM, la parte más difícil - para encontrar los genes responsables de la fenotipo. Breakthrough puede llamar ciertos genes responsables del color de la vaina.

Color, el sabor y los genes

Los científicos, en la secuenciación del genoma del cacao continua operación, no sólo fueron capaces de identificar los genes responsables del color de la vaina de cacao, pero para entender en qué parte del ADN de estos genes son de cacao.

A continuación, los genes fueron etiquetados como "buena" (por los genes de vaina verde) y "malos" (los genes responsables del color rojo). Resulta que los granos de cacao a partir de vainas verdes dan un buen sabor, y rojo -. Mal

Ahora, usando la información recibida, es posible obtener los mejores tipos de cacao en un período muy corto de tiempo. Un trabajo anterior sobre la eliminación de la forma cualitativa de cacao necesitan años y años. Entre otras cosas, los científicos están trabajando para eliminar no sólo los tipos de cacao, que dan fruto con buen sabor, pero ambas especies son resistentes a las influencias externas adversas.

Papel de IBM en el
investigación
La Corporación ha desarrollado algoritmos para identificar regiones del genoma y los genes individuales para identificar los genes que son responsables para el fenotipo de la planta. Esto permite a la empresa de Marte trabajar eficazmente para mejorar el sabor de cacao y resistencia de la planta a factores externos.

En cuanto a los países desarrollados de IBM algoritmos , están abiertos a cualquier comunidad de investigación.

Genoma de cacao tal como se establece en el proyecto de acceso abierto a creó su propio sitio web .

Fuente: habrahabr.ru/company/ibm/blog/234961/