OpenWorm: modelo digital del gusano nematodo en el navegador Bashny.Net

El diminuto nematodo o lombriz Caenorhabditis elegans longitud de alrededor de un milímetro - uno de los organismos más estudiados en el mundo. Esta es la primera organismo multicelular cuyo genoma fue secuenciado completamente. En C. elegans los dos sexos - masculino y germafordity. Espécimen germaforditnaya adulto se compone de sólo 959 células y su sistema nervioso - desde 302 neuronas. Todas las conexiones entre las neuronas C. elegans (коннектом) tan plenamente descrito. La abundancia de información científica completa sobre este gusano y la relativa simplicidad de su estructura Hace unos años inspiró personal de laboratorio del Instituto de Sistemas Complejos de Simulación de Sistemas Informática Ershov, SB RAS para crear un modelo informático integral de C. elegans.

Finalmente proyecto atrajo a varias docenas de miembros de todo el mundo, sin embargo, seguía siendo oscuro e inaccesible para el público en general: no es tan fácil de entender que la abundancia los datos originales con respecto al dispositivo del gusano, y una variedad de subsistemas modelos escritos en diferentes lenguajes de programación, por no hablar de cómo instalar y ejecutar todo en su computadora. Al mismo tiempo, C. elegans es ampliamente utilizado en el estudio de la biología, y la capacidad para "manejar" el modelo del gusano, con los detalles y considerar la dinámica de cómo funciona, no puede ser sobrestimada. Por lo tanto, el equipo del proyecto decidió hacer el modelo disponible en línea - así que cualquiera podía ir al sitio del proyecto y mirar en la "matriz" que habita el cuerpo virtual. Esta es la esencia del proyecto OpenWorm Kick sucesivamente.



Los creadores del modelo se calcula para recoger 120 mil dólares. Durante el primer día se recoge el 10% de esta cantidad, de modo que las posibilidades de éxito son bastante buenos. Baker, listo para donar $ 49 se le dará la oportunidad de comenzar en el sitio del proyecto personalmente C. elegans modelo y ver su "vida" -. Para estudiar el cuerpo desde el interior y el exterior con la ayuda de la visualización tridimensional y observar las más pequeñas hasta las células individuales, los detalles de su vida < br />
Además de crear un curso en línea, lo que explica cómo el dispositivo del gusano, y los algoritmos y técnicas que se utilizan para crear el modelo. Todo el código fuente para el modelo seguirá siendo disponible bajo una licencia de código abierto. Curso en línea academia OpenWorm promesa para comenzar este verano, y el trabajo en el sitio con una simulación del gusano espera terminar la próxima primavera.



Fuente: habrahabr.ru/post/220095/